More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0283 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  87.69 
 
 
464 aa  835    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  75.05 
 
 
463 aa  717    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
464 aa  958    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  72.59 
 
 
466 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.67 
 
 
465 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  75.42 
 
 
485 aa  741    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.03 
 
 
467 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  75.05 
 
 
463 aa  717    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.88 
 
 
458 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  44.88 
 
 
458 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.35 
 
 
460 aa  323  3e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.76 
 
 
450 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.47 
 
 
454 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.23 
 
 
458 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.39 
 
 
458 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.16 
 
 
458 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 
474 aa  219  7e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 
443 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 
462 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.29 
 
 
458 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.04 
 
 
437 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.04 
 
 
456 aa  199  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  33.84 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.08 
 
 
463 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.13 
 
 
467 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  31.62 
 
 
475 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.69 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.32 
 
 
470 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  34.01 
 
 
481 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.01 
 
 
481 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 
469 aa  177  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 
443 aa  173  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.32 
 
 
464 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  31.71 
 
 
460 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  34.28 
 
 
460 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 
483 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.14 
 
 
460 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.58 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  27.75 
 
 
481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.58 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.02 
 
 
462 aa  163  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  31.13 
 
 
481 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 
476 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  33.14 
 
 
491 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.69 
 
 
476 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.31 
 
 
483 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 
490 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.37 
 
 
475 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.66 
 
 
475 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.3 
 
 
470 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.21 
 
 
495 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.3 
 
 
475 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  29.12 
 
 
481 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.36 
 
 
493 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.83 
 
 
475 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.27 
 
 
479 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  28.63 
 
 
471 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.08 
 
 
477 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.36 
 
 
482 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  28.91 
 
 
481 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  28.91 
 
 
481 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  28.66 
 
 
481 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
474 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  28.87 
 
 
481 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  28.91 
 
 
481 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  29.42 
 
 
486 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.36 
 
 
473 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  29.83 
 
 
498 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 
475 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  32.02 
 
 
472 aa  158  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  28.69 
 
 
481 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  32.3 
 
 
475 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  28.69 
 
 
481 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  29.65 
 
 
481 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  30.43 
 
 
470 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  36.79 
 
 
480 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 
480 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  33.71 
 
 
488 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.56 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  32.1 
 
 
486 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  31.73 
 
 
482 aa  156  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
496 aa  156  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  30.43 
 
 
470 aa  156  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.05 
 
 
482 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  29.06 
 
 
490 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
442 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.08 
 
 
486 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
479 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.1 
 
 
487 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.08 
 
 
486 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
455 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.29 
 
 
487 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>