More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0596 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 437 aa  865    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  51.59 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.26 
 
 		 443 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.99 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.05 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.12 
 
 		 442 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  42.86 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.27 
 
 		 446 aa  330  4e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.18 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.58 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.05 
 
 		 458 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.81 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.36 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  37.75 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.79 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  36.96 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.75 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.22 
 
 		 464 aa  243  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.52 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  37.19 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.56 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.57 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.55 
 
 		 497 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 		 483 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.73 
 
 		 476 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.43 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.3 
 
 		 462 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.99 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.99 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.01 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.83 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.47 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.83 
 
 		 459 aa  206  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.31 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.25 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  32.17 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.68 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.81 
 
 		 467 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.46 
 
 		 481 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  32.58 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  34.31 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.26 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.91 
 
 		 460 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  31.57 
 
 		 481 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  31.01 
 
 		 464 aa  189  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.85 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  31.26 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.32 
 
 		 450 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  31.35 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  31.35 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  32.02 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  31.35 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  31.35 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  31.94 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.57 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.11 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  33.11 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.41 
 
 		 470 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  31.8 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  30.67 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  31.94 
 
 		 480 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.18 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.5 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.02 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  32.51 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  31.56 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  32.39 
 
 		 481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  32.19 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  35.25 
 
 		 481 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  30.77 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  32.11 
 
 		 473 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.11 
 
 		 473 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  35.05 
 
 		 498 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  32.56 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  31.42 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  30.82 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.56 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  32.74 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.56 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  30.82 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  31.19 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  30.54 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.27 
 
 		 488 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  30.82 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  31.11 
 
 		 481 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  31.13 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.94 
 
 		 479 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  32.57 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>