More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1233 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
454 aa  924    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.88 
 
 
481 aa  405  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.35 
 
 
458 aa  333  3e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.35 
 
 
459 aa  333  3e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.19 
 
 
475 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.18 
 
 
458 aa  301  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.68 
 
 
457 aa  300  4e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.34 
 
 
457 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
477 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.34 
 
 
474 aa  223  7e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.36 
 
 
458 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
458 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.58 
 
 
458 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.58 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.68 
 
 
437 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 
488 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
473 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.47 
 
 
479 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 
478 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.52 
 
 
456 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 
443 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 
480 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  28.33 
 
 
512 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
478 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 
478 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 
480 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  29.45 
 
 
445 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 
469 aa  178  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 
475 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.45 
 
 
504 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.12 
 
 
454 aa  176  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.07 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 
495 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 
483 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  27.97 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.46 
 
 
504 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 
480 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 
461 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 
480 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 
480 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  29.73 
 
 
489 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 
529 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.34 
 
 
504 aa  171  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 
480 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  29.65 
 
 
513 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.21 
 
 
460 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 
458 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.48 
 
 
458 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  28.97 
 
 
505 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
517 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
505 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
505 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.82 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.08 
 
 
514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  25.8 
 
 
460 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  31.49 
 
 
477 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.71 
 
 
523 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 
503 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
499 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 
462 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 
552 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  28.41 
 
 
467 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.56 
 
 
503 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 
478 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
479 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 
460 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
479 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.24 
 
 
505 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.26 
 
 
498 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 
462 aa  156  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 
464 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  35.94 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 
478 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 
528 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 
462 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 
544 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  27.31 
 
 
488 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  27.94 
 
 
477 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.64 
 
 
470 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 
464 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 
444 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.01 
 
 
460 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.25 
 
 
478 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 
446 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 
543 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>