More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3705 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.7 
 
 
479 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.34 
 
 
478 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.7 
 
 
479 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
478 aa  991    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  57.34 
 
 
430 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  47.71 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.72 
 
 
483 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.26 
 
 
480 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  48.64 
 
 
489 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  55.12 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  54.09 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.49 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.09 
 
 
478 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  49.58 
 
 
477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.75 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  47.08 
 
 
512 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  49.37 
 
 
481 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.88 
 
 
480 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.4 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.76 
 
 
480 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  46.19 
 
 
480 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  48.1 
 
 
477 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.49 
 
 
478 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.95 
 
 
488 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.84 
 
 
477 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.41 
 
 
479 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.87 
 
 
478 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.59 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.21 
 
 
484 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.73 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  30.27 
 
 
542 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
544 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.04 
 
 
552 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.82 
 
 
503 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 
505 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 
505 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.53 
 
 
529 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.05 
 
 
505 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
499 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.2 
 
 
528 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.6 
 
 
517 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 
543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  30.94 
 
 
505 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 
504 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.42 
 
 
505 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
547 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.99 
 
 
498 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.64 
 
 
504 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 
546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.61 
 
 
503 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 
507 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
523 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
458 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 
522 aa  160  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.76 
 
 
504 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 
514 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.87 
 
 
454 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  29.44 
 
 
513 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 
457 aa  156  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.96 
 
 
458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
481 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 
458 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.17 
 
 
458 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.36 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.1 
 
 
443 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 
474 aa  127  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.9 
 
 
459 aa  126  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.87 
 
 
458 aa  123  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 
460 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 
491 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 
437 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.19 
 
 
460 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.76 
 
 
461 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.38 
 
 
459 aa  106  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  26.96 
 
 
458 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.46 
 
 
454 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  27.19 
 
 
477 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.81 
 
 
475 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.81 
 
 
445 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  27.19 
 
 
477 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  25.33 
 
 
482 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.52 
 
 
460 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  26.62 
 
 
460 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 
444 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
463 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 
482 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  25.33 
 
 
481 aa  99.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  26.83 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  26.1 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  26.83 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>