More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2703 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.75 
 
 		 504 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.69 
 
 		 523 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.78 
 
 		 503 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.84 
 
 		 503 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.51 
 
 		 522 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.96 
 
 		 498 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  67.78 
 
 		 499 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.8 
 
 		 505 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 514 aa  1047    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  61.14 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.05 
 
 		 517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.72 
 
 		 504 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  58.51 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.03 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.22 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.22 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.06 
 
 		 504 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.94 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  42.47 
 
 		 542 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.47 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.13 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.24 
 
 		 546 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.04 
 
 		 544 aa  359  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 529 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.19 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.39 
 
 		 547 aa  353  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 495 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.36 
 
 		 477 aa  279  9e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.32 
 
 		 488 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.55 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.86 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.49 
 
 		 478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.83 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  30.19 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  31.76 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.45 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 		 479 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 		 479 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.61 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.83 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.71 
 
 		 480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  31.36 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.75 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  31.25 
 
 		 489 aa  179  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  33.07 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.74 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  35.58 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.59 
 
 		 478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.23 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  38.78 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  34.67 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  38.4 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.71 
 
 		 454 aa  171  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  38.4 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.02 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.85 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.99 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.99 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.2 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.99 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  25 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.83 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  25.2 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  24.59 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.4 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  25 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  26.03 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.88 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 		 458 aa  100  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  23.58 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.75 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  24.75 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  26.56 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.63 
 
 		 450 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.17 
 
 		 473 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  26.51 
 
 		 481 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.22 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.59 
 
 		 462 aa  94.7  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  27.12 
 
 		 481 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.84 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>