More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5939 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.96 
 
 		 503 aa  727    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.07 
 
 		 503 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  68.81 
 
 		 513 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.74 
 
 		 522 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.34 
 
 		 523 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 499 aa  1019    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  70.74 
 
 		 504 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  80.56 
 
 		 498 aa  806    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  71.54 
 
 		 505 aa  730    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.78 
 
 		 514 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.09 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.2 
 
 		 504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.8 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.8 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.8 
 
 		 505 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  62 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.4 
 
 		 504 aa  591  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.45 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.89 
 
 		 528 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.03 
 
 		 546 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  41.97 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.6 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.66 
 
 		 544 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.8 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.32 
 
 		 529 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.98 
 
 		 543 aa  352  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.68 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.64 
 
 		 477 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.93 
 
 		 488 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.24 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.8 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.82 
 
 		 478 aa  213  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  34.38 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  34.97 
 
 		 480 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 480 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.97 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  32.48 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  31.6 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  34.17 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.69 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  31.52 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  30.52 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.31 
 
 		 478 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.77 
 
 		 480 aa  180  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.41 
 
 		 479 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.41 
 
 		 479 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  32.55 
 
 		 481 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.56 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.4 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  36.92 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.22 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 479 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.1 
 
 		 461 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 		 457 aa  126  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.78 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  28.12 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  27.18 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.18 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.25 
 
 		 474 aa  124  6e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.88 
 
 		 477 aa  123  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  26.44 
 
 		 477 aa  123  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  26.19 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  28.15 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 486 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  27.42 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  29.49 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  27.71 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  28.21 
 
 		 483 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.45 
 
 		 470 aa  116  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.04 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  26.11 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  27.6 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.9 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  27.45 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  27.6 
 
 		 480 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.41 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>