More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4997 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  74.17 
 
 
478 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  79.92 
 
 
477 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
483 aa  984    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  80.12 
 
 
477 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  74.17 
 
 
478 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  60.13 
 
 
512 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.13 
 
 
480 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.13 
 
 
480 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.7 
 
 
480 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.68 
 
 
480 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  60.47 
 
 
480 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  62.02 
 
 
481 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.49 
 
 
480 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.23 
 
 
480 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  60.6 
 
 
477 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  60.34 
 
 
477 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  57.26 
 
 
489 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.85 
 
 
478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.86 
 
 
479 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.76 
 
 
479 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.72 
 
 
478 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.2 
 
 
478 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  53.5 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  42.68 
 
 
488 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.98 
 
 
479 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.91 
 
 
477 aa  262  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.03 
 
 
478 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.76 
 
 
478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.41 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 
484 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 
495 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.68 
 
 
503 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.98 
 
 
498 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.51 
 
 
507 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  33.56 
 
 
499 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 
542 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.69 
 
 
504 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.11 
 
 
517 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.53 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.87 
 
 
529 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.48 
 
 
544 aa  173  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 
454 aa  173  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
505 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
505 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
505 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  33.33 
 
 
505 aa  170  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.31 
 
 
503 aa  170  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
552 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.35 
 
 
514 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 
547 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  30.36 
 
 
513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.11 
 
 
504 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.75 
 
 
543 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.75 
 
 
528 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.96 
 
 
523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
546 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.84 
 
 
458 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.8 
 
 
522 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.89 
 
 
459 aa  147  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.07 
 
 
481 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
457 aa  143  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.23 
 
 
457 aa  139  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 
475 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24 
 
 
458 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
458 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.78 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.24 
 
 
497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.56 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  32.3 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.13 
 
 
474 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 
483 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  30.5 
 
 
460 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
465 aa  104  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.94 
 
 
463 aa  103  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 
460 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 
460 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.27 
 
 
475 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.19 
 
 
437 aa  101  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.87 
 
 
467 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.25 
 
 
443 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
471 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.8 
 
 
471 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
493 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.68 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.03 
 
 
476 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.22 
 
 
470 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
470 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  23.11 
 
 
445 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  27.24 
 
 
458 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.17 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>