More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3719 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
478 aa  996    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.31 
 
 
479 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.31 
 
 
479 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 
478 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  55.01 
 
 
430 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  49.15 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.2 
 
 
483 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  45.89 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  47.48 
 
 
477 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  47.27 
 
 
477 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  45.78 
 
 
478 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.19 
 
 
480 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.89 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.38 
 
 
480 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.88 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  45.59 
 
 
512 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.96 
 
 
480 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.96 
 
 
480 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  45.21 
 
 
477 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.51 
 
 
478 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.72 
 
 
480 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  44.35 
 
 
481 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  43.91 
 
 
480 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  43.96 
 
 
477 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
477 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.34 
 
 
488 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.13 
 
 
479 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 
478 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.77 
 
 
478 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.67 
 
 
484 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.87 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
505 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
505 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
505 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.61 
 
 
504 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 
542 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.75 
 
 
503 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  29.89 
 
 
505 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.83 
 
 
514 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 
552 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 
504 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 
499 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.16 
 
 
505 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.13 
 
 
543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.86 
 
 
547 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.75 
 
 
503 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.77 
 
 
498 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 
454 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.26 
 
 
528 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.48 
 
 
504 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  29.49 
 
 
513 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 
517 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.12 
 
 
529 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 
544 aa  177  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 
458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 
546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.36 
 
 
507 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 
522 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 
473 aa  170  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 
458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.59 
 
 
475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 
481 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 
457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.68 
 
 
458 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.05 
 
 
459 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 
474 aa  156  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.77 
 
 
458 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 
454 aa  130  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 
461 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  26.47 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  26.54 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.78 
 
 
475 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  27.42 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.26 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.9 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  29.25 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  26.32 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  25.71 
 
 
482 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 
491 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  26.57 
 
 
483 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  26.71 
 
 
480 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  26.71 
 
 
480 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28 
 
 
446 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.21 
 
 
462 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.23 
 
 
470 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  26 
 
 
479 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>