More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3765 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  93.51 
 
 		 478 aa  850    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 478 aa  957    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  74.63 
 
 		 479 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.75 
 
 		 477 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.28 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 		 495 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  40.43 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.87 
 
 		 483 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.52 
 
 		 480 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.86 
 
 		 505 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.53 
 
 		 504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.84 
 
 		 478 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.6 
 
 		 480 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.96 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  35.43 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.19 
 
 		 479 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.19 
 
 		 479 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.22 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  35.61 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.7 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.23 
 
 		 480 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  40.24 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  40.74 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.54 
 
 		 484 aa  249  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.63 
 
 		 478 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  35.23 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.87 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  36.8 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  35.44 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.7 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 552 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.13 
 
 		 528 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.82 
 
 		 543 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  38.41 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  39.39 
 
 		 488 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.46 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.8 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 523 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  30.43 
 
 		 542 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.77 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.86 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 		 503 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.92 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.86 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.08 
 
 		 507 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  35.15 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  44.69 
 
 		 481 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.92 
 
 		 504 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  34.76 
 
 		 505 aa  226  6e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.98 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.07 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.45 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.96 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 		 459 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  28.44 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.08 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.69 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 		 491 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.48 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.56 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.49 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  26.33 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.96 
 
 		 461 aa  118  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.61 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.58 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  26.1 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 460 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>