More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2188 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 507 aa  1006    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.98 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  54.45 
 
 		 499 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.85 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.11 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.71 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.88 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.06 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.06 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.86 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  54.05 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.39 
 
 		 522 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.12 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.19 
 
 		 503 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.94 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.12 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  53.16 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.94 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 		 528 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.98 
 
 		 552 aa  329  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  35.69 
 
 		 542 aa  323  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.34 
 
 		 529 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.5 
 
 		 547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.26 
 
 		 477 aa  293  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.98 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.62 
 
 		 544 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.36 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.2 
 
 		 488 aa  275  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.71 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.66 
 
 		 479 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.08 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.87 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  29.05 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  32.01 
 
 		 512 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.01 
 
 		 480 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.06 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.51 
 
 		 483 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  32.43 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  31.63 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.86 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  34.79 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 		 479 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 		 481 aa  170  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 		 479 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.04 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.43 
 
 		 478 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.6 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  32.42 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.46 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  32.16 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.18 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.44 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.69 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 473 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.7 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.25 
 
 		 473 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.75 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.39 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.35 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  30.4 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.4 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.43 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  30.19 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  29.65 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  23.33 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.47 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  29.43 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.07 
 
 		 490 aa  106  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.6 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.26 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  31.47 
 
 		 474 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.37 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  28.01 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>