More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1327 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 495 aa  1034    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.4 
 
 		 529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.64 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.38 
 
 		 528 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.72 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 547 aa  351  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  38.12 
 
 		 542 aa  348  9e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.15 
 
 		 543 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.06 
 
 		 504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.79 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.14 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 505 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  37.68 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.72 
 
 		 544 aa  322  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.78 
 
 		 504 aa  322  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.55 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  40.81 
 
 		 505 aa  319  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 514 aa  316  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.37 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.59 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.3 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.37 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.56 
 
 		 505 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.56 
 
 		 505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.56 
 
 		 505 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  36.69 
 
 		 513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.82 
 
 		 503 aa  306  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.25 
 
 		 522 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.92 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.21 
 
 		 507 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.52 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.83 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  31.11 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.73 
 
 		 478 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.62 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.11 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.87 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  30.91 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 483 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  34.29 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.48 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  34.5 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.83 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.3 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.05 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.32 
 
 		 480 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  33.73 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  33.16 
 
 		 477 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  32.18 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  33.42 
 
 		 477 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 475 aa  146  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.35 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.95 
 
 		 473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.47 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  27.83 
 
 		 458 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.61 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 		 437 aa  124  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.73 
 
 		 465 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  24.6 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.75 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  26.86 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  24.88 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.98 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.17 
 
 		 457 aa  110  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.44 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.61 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  24.3 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>