More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1149 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  67.2 
 
 
513 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72 
 
 
498 aa  726    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.4 
 
 
503 aa  695    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.47 
 
 
503 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.18 
 
 
504 aa  722    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.8 
 
 
522 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.98 
 
 
523 aa  685    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  71.54 
 
 
499 aa  738    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
505 aa  1028    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  64.74 
 
 
505 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.1 
 
 
517 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.07 
 
 
505 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.27 
 
 
504 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.07 
 
 
505 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.07 
 
 
505 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.8 
 
 
514 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.87 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.85 
 
 
507 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.19 
 
 
546 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.31 
 
 
528 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.09 
 
 
552 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.44 
 
 
547 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  40.23 
 
 
542 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.15 
 
 
544 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.3 
 
 
529 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.35 
 
 
543 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 
495 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 
477 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.79 
 
 
488 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.86 
 
 
478 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.89 
 
 
479 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 
478 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.23 
 
 
484 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 
480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  33.4 
 
 
489 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.59 
 
 
479 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 
479 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.96 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
478 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  33.33 
 
 
478 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  34.24 
 
 
480 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 
478 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
480 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  29.4 
 
 
488 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  30.54 
 
 
512 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.16 
 
 
477 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.63 
 
 
483 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 
481 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.94 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.16 
 
 
480 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  30.25 
 
 
477 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.31 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.06 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  30.66 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  35.18 
 
 
430 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.46 
 
 
457 aa  159  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.81 
 
 
475 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 
481 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.85 
 
 
473 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
474 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.33 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
458 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.9 
 
 
458 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.74 
 
 
459 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 
458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.89 
 
 
456 aa  116  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  29.09 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.28 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.63 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.74 
 
 
458 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.65 
 
 
443 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.04 
 
 
458 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 
461 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 
479 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  27.11 
 
 
483 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.16 
 
 
486 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 
486 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 
477 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  28.37 
 
 
481 aa  104  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.18 
 
 
481 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  30.18 
 
 
481 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  28.27 
 
 
474 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  27.57 
 
 
473 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 
473 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.97 
 
 
445 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  26.74 
 
 
486 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 
476 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.02 
 
 
489 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>