More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA2066 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  78.87 
 
 
478 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  99.79 
 
 
477 aa  963    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  80.12 
 
 
483 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  79.5 
 
 
478 aa  750    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  100 
 
 
477 aa  966    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.25 
 
 
480 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.05 
 
 
480 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.13 
 
 
480 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  60.29 
 
 
477 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  60.08 
 
 
477 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  59.91 
 
 
512 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.48 
 
 
480 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  61.08 
 
 
481 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.27 
 
 
480 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.27 
 
 
480 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  58.62 
 
 
480 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  57.26 
 
 
489 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.43 
 
 
478 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.48 
 
 
478 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.25 
 
 
479 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.35 
 
 
479 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  54.78 
 
 
430 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.47 
 
 
478 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  45.23 
 
 
488 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.96 
 
 
479 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.74 
 
 
478 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.56 
 
 
477 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.59 
 
 
478 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.33 
 
 
488 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
484 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 
495 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.42 
 
 
504 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.51 
 
 
503 aa  183  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  33.72 
 
 
499 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
529 aa  183  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.98 
 
 
517 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.39 
 
 
505 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.07 
 
 
514 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.39 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.72 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 
552 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
505 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 
503 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
505 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 
454 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  30.99 
 
 
513 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.14 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.38 
 
 
547 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.6 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  29.79 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.13 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.02 
 
 
481 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 
542 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.25 
 
 
523 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.78 
 
 
504 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 
543 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 
458 aa  154  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.41 
 
 
522 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 
546 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.24 
 
 
473 aa  149  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.05 
 
 
457 aa  147  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.53 
 
 
475 aa  146  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 
459 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 
458 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.4 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.38 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.16 
 
 
458 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.56 
 
 
458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
460 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.22 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 
474 aa  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.49 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  30.86 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
458 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.36 
 
 
458 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
437 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
460 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
460 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.37 
 
 
445 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  30.23 
 
 
460 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.76 
 
 
475 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.04 
 
 
461 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 
469 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  25.63 
 
 
467 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  27.63 
 
 
486 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 
491 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.74 
 
 
476 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
464 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.63 
 
 
486 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 
486 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  27.17 
 
 
466 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.2 
 
 
444 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>