More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3429 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.76 
 
 
504 aa  661    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  88.51 
 
 
504 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  99.6 
 
 
505 aa  1014    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
505 aa  1018    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  81.78 
 
 
505 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
505 aa  1018    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  85.54 
 
 
504 aa  843    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.07 
 
 
505 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.67 
 
 
498 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  61.8 
 
 
499 aa  616  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.1 
 
 
523 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.86 
 
 
522 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.85 
 
 
503 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.48 
 
 
503 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.74 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  59.92 
 
 
513 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.22 
 
 
514 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.06 
 
 
507 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.52 
 
 
552 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  41.86 
 
 
542 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 
546 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.8 
 
 
528 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.57 
 
 
544 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.58 
 
 
543 aa  361  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.32 
 
 
547 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.03 
 
 
529 aa  352  7e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.45 
 
 
495 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.38 
 
 
477 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.13 
 
 
488 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.32 
 
 
478 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.2 
 
 
479 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.06 
 
 
478 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.8 
 
 
480 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.34 
 
 
480 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.38 
 
 
480 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  30.8 
 
 
480 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
478 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  31.34 
 
 
512 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.43 
 
 
480 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.31 
 
 
480 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 
479 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 
479 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  28.86 
 
 
488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
480 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  31.41 
 
 
489 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.98 
 
 
478 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  35.87 
 
 
430 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 
481 aa  176  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 
478 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  33.43 
 
 
477 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.43 
 
 
483 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  30.74 
 
 
477 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  32.39 
 
 
478 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  29.31 
 
 
477 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
454 aa  168  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.34 
 
 
481 aa  159  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.69 
 
 
475 aa  151  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.59 
 
 
458 aa  151  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.03 
 
 
473 aa  149  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.44 
 
 
443 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.35 
 
 
459 aa  134  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.58 
 
 
474 aa  130  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
458 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
458 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 
458 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
457 aa  125  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.88 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.27 
 
 
445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 
477 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.43 
 
 
459 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25 
 
 
458 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.31 
 
 
456 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  26.48 
 
 
473 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.88 
 
 
462 aa  106  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 
460 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  28.81 
 
 
484 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 
460 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  26.72 
 
 
460 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.47 
 
 
473 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.22 
 
 
490 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.48 
 
 
491 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  27.71 
 
 
474 aa  100  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
460 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.73 
 
 
458 aa  99.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 
485 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.57 
 
 
437 aa  98.6  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>