More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4163 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
479 aa  996    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  99.79 
 
 
479 aa  995    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.31 
 
 
478 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.7 
 
 
478 aa  712    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  50.96 
 
 
488 aa  475  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  55.84 
 
 
430 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.76 
 
 
483 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  46 
 
 
489 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  46.47 
 
 
512 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.86 
 
 
480 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.06 
 
 
480 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.04 
 
 
480 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.95 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.44 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.85 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.61 
 
 
478 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  52.63 
 
 
478 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  47.49 
 
 
477 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.23 
 
 
480 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  46.85 
 
 
481 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  46.25 
 
 
477 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  46.44 
 
 
480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  46.04 
 
 
477 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.73 
 
 
479 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.96 
 
 
477 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.42 
 
 
488 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.74 
 
 
478 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.62 
 
 
478 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 
484 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31 
 
 
495 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.4 
 
 
504 aa  200  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 
542 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.54 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.9 
 
 
517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.08 
 
 
503 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.42 
 
 
552 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.76 
 
 
505 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.06 
 
 
505 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.06 
 
 
505 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.21 
 
 
505 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 
523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.02 
 
 
498 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.85 
 
 
504 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.15 
 
 
543 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 
514 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 
499 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  29.57 
 
 
505 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.21 
 
 
528 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.42 
 
 
503 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.09 
 
 
544 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.64 
 
 
546 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.92 
 
 
522 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 
458 aa  168  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  35.77 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.67 
 
 
529 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.92 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 
457 aa  159  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
454 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.71 
 
 
473 aa  158  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 
475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
458 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 
458 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
458 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.24 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.23 
 
 
443 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.32 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
458 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.61 
 
 
474 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  27.33 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  27.33 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  27.33 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  27.17 
 
 
481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  26.87 
 
 
445 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  26.24 
 
 
481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.03 
 
 
475 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  25.05 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  25.98 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  26.7 
 
 
481 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  26.83 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  26.92 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 
444 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.95 
 
 
454 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  26.7 
 
 
481 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 
459 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>