More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3490 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.12 
 
 		 552 aa  791    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.5 
 
 		 544 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.08 
 
 		 547 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.17 
 
 		 528 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 542 aa  1122    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.68 
 
 		 543 aa  693    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.33 
 
 		 546 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.69 
 
 		 529 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.32 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  41.97 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.47 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42 
 
 		 498 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.27 
 
 		 523 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.54 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.42 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  41.79 
 
 		 505 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.79 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.79 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.25 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.79 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  40.12 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.15 
 
 		 522 aa  363  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.98 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.59 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.12 
 
 		 495 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.69 
 
 		 507 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.8 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.16 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.99 
 
 		 479 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.71 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  31.13 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 		 479 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 		 479 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.62 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  30.12 
 
 		 488 aa  189  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.27 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.28 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.12 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 		 480 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.44 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  31.83 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  32.96 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.67 
 
 		 478 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 		 454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  26.36 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  35.23 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  34.63 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.6 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  34.48 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  29.53 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  28.11 
 
 		 512 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.76 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.52 
 
 		 481 aa  147  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 		 491 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 		 457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.81 
 
 		 460 aa  130  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.37 
 
 		 437 aa  124  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.04 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.2 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.4 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.55 
 
 		 458 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.54 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.9 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  25.47 
 
 		 445 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.36 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.67 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.46 
 
 		 458 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  24.5 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.67 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.61 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  26.57 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  23.94 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.79 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 		 482 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.89 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  26.86 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.92 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>