More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1368 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1049    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.26 
 
 		 503 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.25 
 
 		 504 aa  647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67 
 
 		 498 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  68.81 
 
 		 499 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.07 
 
 		 505 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.29 
 
 		 522 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.92 
 
 		 503 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.23 
 
 		 523 aa  606  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  61.14 
 
 		 514 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12338  hypothetical protein  60.44 
 
 		 505 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.68 
 
 		 504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.92 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.92 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.92 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5318  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.46 
 
 		 517 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.88 
 
 		 504 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2188  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.16 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0732335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.36 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  40.12 
 
 		 542 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.35 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.76 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.84 
 
 		 547 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.72 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.15 
 
 		 529 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39 
 
 		 543 aa  342  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.69 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.92 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.6 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.05 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.15 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.12 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.12 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.05 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.69 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.97 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  28.78 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  31.05 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  33.24 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.83 
 
 		 458 aa  172  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.52 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  32.54 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  32.79 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  35.22 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.21 
 
 		 480 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 		 479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 480 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2707  hypothetical protein  31.87 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.161741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  29.06 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.52 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  37.5 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.52 
 
 		 480 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.57 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39820  modulator of DNA gyrase  31.49 
 
 		 481 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.356312  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.15 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  27.65 
 
 		 473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.47 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.63 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.22 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.04 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  27.51 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  26.83 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.01 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.02 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  27.86 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.58 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.34 
 
 		 490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  26.21 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.8 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.52 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.29 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  27 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  29.07 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.93 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>