More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1055 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 473 aa  981    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.36 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.45 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.11 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.27 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.16 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.37 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.64 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.08 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.23 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 		 437 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.44 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.89 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.65 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.97 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  27.94 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 		 488 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.08 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.64 
 
 		 546 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  30.91 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.71 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.71 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 552 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 543 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.22 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 542 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  31.55 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.19 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5245  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.88 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413306  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  26.95 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.43 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  26.58 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  26.65 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  27.61 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 		 498 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  28.24 
 
 		 477 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.39 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  27.25 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.56 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.34 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 		 450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.44 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 		 503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  27.57 
 
 		 464 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.59 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.51 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.39 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.66 
 
 		 475 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.86 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  25.79 
 
 		 513 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.15 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.99 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  25.69 
 
 		 475 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.2 
 
 		 482 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.62 
 
 		 475 aa  143  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 		 476 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.77 
 
 		 486 aa  143  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  29.69 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  30.89 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.4 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  33.2 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  33.2 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  33.2 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>