More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2121 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
458 aa  927    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.46 
 
 
459 aa  539  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.48 
 
 
481 aa  363  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.35 
 
 
454 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.6 
 
 
475 aa  283  6.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.87 
 
 
458 aa  249  5e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.19 
 
 
457 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.02 
 
 
457 aa  234  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.23 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 
477 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32 
 
 
458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 
458 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  25.79 
 
 
472 aa  158  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.43 
 
 
458 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 
458 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.3 
 
 
488 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  26.6 
 
 
470 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.97 
 
 
477 aa  150  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
460 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.39 
 
 
470 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.45 
 
 
469 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  26.39 
 
 
470 aa  148  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.12 
 
 
479 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  29.38 
 
 
460 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  29.23 
 
 
467 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
437 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.29 
 
 
474 aa  143  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.45 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.77 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2989  putative Zn-dependent protease, modulator of DNA gyrase, TldD  28.52 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  26.09 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.9 
 
 
461 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.45 
 
 
478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.51 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  29.22 
 
 
460 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.46 
 
 
483 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
458 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2558  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 
478 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1452  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
478 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0382327  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.37 
 
 
471 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  26.3 
 
 
458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.45 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.07 
 
 
464 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  32.91 
 
 
460 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  25.73 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 
462 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
460 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.79 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  27.38 
 
 
477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.59 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.12 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.62 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 
465 aa  133  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.51 
 
 
443 aa  133  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
479 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 
479 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 
486 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  30.77 
 
 
512 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  31.83 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0755  TldD/PmbA family protein  32.85 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44281  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.68 
 
 
497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.39 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.89 
 
 
459 aa  131  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1846  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 
459 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0233195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  27.03 
 
 
475 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1428  TldD family protein  25.17 
 
 
489 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  29.48 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 
480 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 
475 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.48 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.19 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0749  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.69 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.34 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 
495 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.8 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  27.76 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  26.54 
 
 
480 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  27.97 
 
 
473 aa  127  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2406  TldD/PmbA family protein  31.84 
 
 
488 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.410379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.51 
 
 
498 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  29.56 
 
 
477 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 
479 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>