More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_468 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  95.85 
 
 		 458 aa  914    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  96.29 
 
 		 458 aa  897    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 461 aa  954    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.45 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  44.81 
 
 		 464 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.81 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.81 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.02 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.2 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  43.69 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.7 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.77 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.09 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.53 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.03 
 
 		 443 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.97 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.68 
 
 		 458 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.84 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.12 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  34.15 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 		 437 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 442 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.73 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.93 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.18 
 
 		 475 aa  192  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.27 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.02 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 443 aa  183  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.52 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.97 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 		 491 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.94 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  33.44 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.78 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.4 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.46 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  36.7 
 
 		 491 aa  173  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.87 
 
 		 483 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.89 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  30.67 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.19 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.1 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  30.49 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.42 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.63 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.93 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.29 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.8 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  28.3 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  30.44 
 
 		 481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  29.49 
 
 		 475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.13 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  29.31 
 
 		 481 aa  166  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.9 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  29.31 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  29.53 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  31 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.88 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.02 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  29.89 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  33.01 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  33.01 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  34.67 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.53 
 
 		 488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  33.01 
 
 		 497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.32 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.52 
 
 		 486 aa  163  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  28.94 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  30.75 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 		 488 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  29.87 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  39.02 
 
 		 481 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  39.44 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  32.4 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  38.52 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  28.48 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  30.4 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.22 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  38.52 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.29 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  29.18 
 
 		 488 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.82 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.08 
 
 		 487 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  38.71 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  34.81 
 
 		 498 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  28 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.94 
 
 		 479 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.08 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>