More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2693 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 442 aa  897    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.44 
 
 		 446 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.35 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.73 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  51.91 
 
 		 445 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  46.62 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.12 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.62 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.93 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 458 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.19 
 
 		 458 aa  249  7e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.64 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.27 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.25 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  31.83 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.39 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.65 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.18 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.21 
 
 		 463 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.1 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.66 
 
 		 497 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 		 476 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  33.64 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.84 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.99 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.79 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  32.03 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  34.15 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.98 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.45 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.29 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.11 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.29 
 
 		 475 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  31.11 
 
 		 466 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  31 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.01 
 
 		 487 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  32.29 
 
 		 498 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  31.35 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.74 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.33 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  31.44 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  37.05 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.67 
 
 		 443 aa  145  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.12 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.05 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 		 490 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 512 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.65 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  28.73 
 
 		 464 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  31.74 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 479 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.8 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.25 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  36.76 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  36.76 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.55 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.49 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  36.25 
 
 		 488 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.26 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 		 496 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  32.96 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.13 
 
 		 464 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.68 
 
 		 486 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.37 
 
 		 493 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  30.68 
 
 		 486 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.67 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.23 
 
 		 481 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  30.54 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  30.54 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.8 
 
 		 482 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.84 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.6 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  30.36 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.52 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  30.71 
 
 		 487 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>