More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0639 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 453 aa  907    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.36 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.7 
 
 		 448 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  46.44 
 
 		 452 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.24 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  46.7 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.37 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.24 
 
 		 465 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.69 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.08 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.5 
 
 		 463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  41.91 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.37 
 
 		 465 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  43.92 
 
 		 448 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.99 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.43 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  41.48 
 
 		 448 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.31 
 
 		 456 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  42.86 
 
 		 447 aa  299  8e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  42.63 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.95 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.51 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.56 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.64 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  42.57 
 
 		 445 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  38.34 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  35.96 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  32.29 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.95 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  40.57 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.33 
 
 		 447 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  33.03 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  39.05 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  35.16 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  32.52 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.67 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.47 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  37.01 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  35.45 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  33.8 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.51 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  34.25 
 
 		 447 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.86 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  34.14 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  33.11 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.08 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  34.16 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.88 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  32.96 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  34.47 
 
 		 447 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  32.88 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  32.88 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  32.88 
 
 		 446 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  32.05 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.32 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  32.58 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  34.68 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  31.08 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  33.64 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  33.11 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  34.02 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.04 
 
 		 455 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  33.26 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  33.26 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  32.3 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.56 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  33.56 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  33.11 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.5 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.05 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  32.21 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.63 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.21 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  32.72 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  32.72 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  32.72 
 
 		 446 aa  220  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  31.67 
 
 		 453 aa  219  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  31 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  32.6 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  31 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.1 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  30.49 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.59 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.42 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  33.33 
 
 		 455 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.27 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3067  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.81 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.7 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.75 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>