More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0569 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 447 aa  880    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.14 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  61.66 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.14 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  51.93 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.94 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.9 
 
 		 446 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.46 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.21 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.23 
 
 		 465 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.23 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  51.96 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.45 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.95 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  48.06 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.21 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  45.98 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  47.52 
 
 		 447 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.19 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  47.3 
 
 		 447 aa  336  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.96 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.54 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  48.76 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  46.79 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.73 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  43.21 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.29 
 
 		 443 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.3 
 
 		 448 aa  312  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  39.77 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  40.84 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.69 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.5 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  43.45 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  39.41 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.72 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  37.24 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.27 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  42.37 
 
 		 455 aa  269  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  39.73 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  36.64 
 
 		 450 aa  267  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.18 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  34.03 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  36.87 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  36.64 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  36.64 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  36.64 
 
 		 450 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  38.05 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.42 
 
 		 450 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.39 
 
 		 455 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  38.34 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  36.42 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  40.77 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  36.2 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  36.2 
 
 		 446 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  37.22 
 
 		 446 aa  259  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  36.36 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  37.22 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  36.85 
 
 		 446 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  41.11 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.87 
 
 		 455 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  37.08 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  35.51 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  37.08 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  34.16 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  39.29 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  39.29 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 		 456 aa  247  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.53 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.14 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  40.53 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  36.73 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.73 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.77 
 
 		 468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.1 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.83 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  35.25 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  36.04 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  38.85 
 
 		 447 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  38.08 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  38.02 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.1 
 
 		 448 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  35.63 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  35.63 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  39.76 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.24 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.23 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.35 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  36.69 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.14 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  36.95 
 
 		 476 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.78 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  34.92 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  38.81 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>