More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0650 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  79.05 
 
 
444 aa  746    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  100 
 
 
448 aa  902    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  51.35 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.61 
 
 
468 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.34 
 
 
463 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.65 
 
 
479 aa  323  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  41.4 
 
 
464 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  38.19 
 
 
452 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  40.8 
 
 
448 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.45 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.63 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.76 
 
 
465 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.25 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.81 
 
 
448 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  42.2 
 
 
445 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.59 
 
 
456 aa  296  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  37.88 
 
 
447 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  37.88 
 
 
447 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.24 
 
 
442 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.52 
 
 
448 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 
446 aa  286  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.76 
 
 
448 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.76 
 
 
448 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  37.59 
 
 
443 aa  274  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  36.28 
 
 
448 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  36.59 
 
 
460 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.35 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  35.32 
 
 
448 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.32 
 
 
448 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  33.26 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.52 
 
 
453 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  32.24 
 
 
473 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 
463 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.15 
 
 
448 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  31.85 
 
 
450 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  31.85 
 
 
450 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.62 
 
 
450 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  31.62 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  31.62 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  31.62 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  31.62 
 
 
446 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  31.85 
 
 
450 aa  232  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  31.62 
 
 
450 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  30.84 
 
 
450 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  32.86 
 
 
447 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 
441 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.31 
 
 
447 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  31.15 
 
 
446 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  31.15 
 
 
446 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  31.15 
 
 
446 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  31.15 
 
 
446 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  31.15 
 
 
446 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.83 
 
 
443 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  33.5 
 
 
449 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.04 
 
 
450 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.66 
 
 
456 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  32.45 
 
 
432 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 
456 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.66 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  38.34 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  32.44 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.79 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  31.13 
 
 
444 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.04 
 
 
453 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.34 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  31.69 
 
 
447 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  29.69 
 
 
446 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
456 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.48 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.48 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  30.59 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  30.21 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  32.82 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  31.4 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  28.32 
 
 
447 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.25 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  31.4 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.79 
 
 
447 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  31.4 
 
 
447 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.27 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  30.82 
 
 
486 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  33.16 
 
 
440 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
469 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  29.98 
 
 
446 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.5 
 
 
481 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  28.99 
 
 
446 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.38 
 
 
460 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.88 
 
 
448 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  28.1 
 
 
447 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  30.93 
 
 
453 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 
450 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.98 
 
 
445 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  29.91 
 
 
447 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  29.73 
 
 
446 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  29.73 
 
 
446 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  30.16 
 
 
456 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  30.87 
 
 
498 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  30.16 
 
 
456 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.96 
 
 
441 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>