More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3343 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 453 aa  913    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  42.83 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.45 
 
 		 468 aa  293  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 448 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  37.64 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  36.77 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.77 
 
 		 448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.13 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  37 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  37.1 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.1 
 
 		 448 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.64 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.87 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  35.2 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  36.3 
 
 		 448 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  37.44 
 
 		 455 aa  269  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  35.94 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  34.92 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  36.59 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  36.59 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.55 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.97 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  35.78 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  35.12 
 
 		 446 aa  265  8.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.78 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.86 
 
 		 448 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  35.43 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  35.51 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  36.16 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.51 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.51 
 
 		 461 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  36.14 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.51 
 
 		 461 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.51 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.43 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.14 
 
 		 469 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  36.9 
 
 		 452 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  37.59 
 
 		 455 aa  260  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.22 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  35.28 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  35.28 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.09 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.65 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  35.68 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.63 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  35.78 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  35.78 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.78 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  35.41 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  38.33 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  35.45 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  34.24 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.06 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.97 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 		 456 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  35.15 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 		 456 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.67 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.25 
 
 		 448 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.34 
 
 		 479 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.49 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  35.56 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  35.33 
 
 		 498 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.58 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  36.87 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.58 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.58 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  34.42 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  34.36 
 
 		 456 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.16 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.75 
 
 		 450 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  34.75 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  35.23 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.76 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  35.28 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  34.75 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  35.79 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  34.75 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.47 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.47 
 
 		 468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.85 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  34.47 
 
 		 486 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  35.33 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.6 
 
 		 448 aa  246  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>