More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2965 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0945  putative PMBA protein (tlde protein)  74.18 
 
 		 457 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0171463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  86.62 
 
 		 456 aa  792    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  86.62 
 
 		 456 aa  792    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  75.06 
 
 		 460 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  86.62 
 
 		 456 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  86.62 
 
 		 456 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  89.04 
 
 		 470 aa  812    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  88.16 
 
 		 456 aa  805    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  86.84 
 
 		 456 aa  793    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  86.62 
 
 		 456 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.52 
 
 		 457 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  88.38 
 
 		 456 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  87.06 
 
 		 498 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 456 aa  937    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  92.98 
 
 		 456 aa  853    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  98.25 
 
 		 456 aa  923    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  89.04 
 
 		 456 aa  811    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  75.06 
 
 		 455 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  88.38 
 
 		 456 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  86.62 
 
 		 456 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  89.04 
 
 		 456 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  88.38 
 
 		 456 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.09 
 
 		 457 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.92 
 
 		 448 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.47 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  63.09 
 
 		 455 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.26 
 
 		 456 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.81 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  62.53 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.53 
 
 		 469 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  61.49 
 
 		 476 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  60.89 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.91 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  57.75 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.71 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.06 
 
 		 448 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.47 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.8 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.98 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  58.2 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  56.12 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  53.53 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  51.71 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.01 
 
 		 448 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.81 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.54 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  49.43 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.56 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  51.56 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  47.01 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  52.44 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.01 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  46.81 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.01 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  47.4 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.23 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  47.84 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.01 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  48.29 
 
 		 450 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  47.61 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.61 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.1 
 
 		 455 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  47.84 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  47.84 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  47.84 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  47.61 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  47.61 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  47.15 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  47.38 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  46.92 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.12 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  47.73 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.17 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.14 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  44.87 
 
 		 452 aa  398  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  45.1 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  46.92 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  47.36 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.44 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  48.34 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  47.03 
 
 		 447 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.99 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  47.75 
 
 		 449 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  47.3 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.01 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.24 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.01 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  49.05 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  47.04 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.24 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  47.52 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.23 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.27 
 
 		 455 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  47.27 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.56 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>