More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0945 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0945  putative PMBA protein (tlde protein)  100 
 
 		 457 aa  933    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0171463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  84.27 
 
 		 460 aa  747    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  74.18 
 
 		 456 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  91.68 
 
 		 457 aa  831    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  77.24 
 
 		 456 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  75.71 
 
 		 498 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.85 
 
 		 456 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  77.68 
 
 		 456 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  75.05 
 
 		 456 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  79.78 
 
 		 470 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  68.15 
 
 		 448 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  75.71 
 
 		 456 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  78.12 
 
 		 456 aa  719    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  85.36 
 
 		 455 aa  756    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  77.68 
 
 		 456 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  91.68 
 
 		 457 aa  832    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  78.12 
 
 		 456 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  77.68 
 
 		 456 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  75.71 
 
 		 456 aa  700    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.48 
 
 		 448 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.86 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.91 
 
 		 456 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.84 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  63.58 
 
 		 455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.52 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  63.52 
 
 		 486 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  64.21 
 
 		 476 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.82 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.28 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  61.69 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  60.04 
 
 		 447 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.85 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  61.38 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.91 
 
 		 452 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  57.14 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  58.05 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  53.53 
 
 		 452 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.02 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  52.16 
 
 		 434 aa  441  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.11 
 
 		 441 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.89 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  48.89 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  52.04 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.34 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  49.89 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.68 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.89 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  54.32 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.32 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  48.02 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  49.89 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  48.44 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  48.17 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  47.58 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.36 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  48.17 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.81 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  48.02 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  47.58 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  47.58 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.44 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  48.08 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  48.08 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  48.08 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  48.08 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  49.88 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  47.23 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.95 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  48.42 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.4 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  49.1 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  48.65 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.05 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  47.97 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.84 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  51.49 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  49.1 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  48.22 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  48.22 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.91 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  48 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  47.86 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  48.78 
 
 		 440 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  49.02 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  50.8 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.8 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  51.14 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  47.6 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.17 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>