More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0661 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
445 aa  887    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.14 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.61 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.79 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.68 
 
 
462 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.21 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  42.45 
 
 
446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.58 
 
 
445 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.98 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.03 
 
 
446 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.55 
 
 
446 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  39.56 
 
 
460 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.91 
 
 
442 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 
453 aa  279  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
442 aa  252  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.59 
 
 
468 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.37 
 
 
437 aa  242  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.7 
 
 
450 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.83 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.59 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  27.56 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  34.82 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.63 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  31.97 
 
 
450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 
442 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.1 
 
 
465 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.42 
 
 
438 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  31.97 
 
 
450 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  35.03 
 
 
447 aa  210  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  28.32 
 
 
448 aa  210  5e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  31.97 
 
 
450 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 
456 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  31.75 
 
 
450 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.75 
 
 
450 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.32 
 
 
435 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  31.75 
 
 
450 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  34.81 
 
 
447 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 
479 aa  208  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 
465 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  34.76 
 
 
464 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.88 
 
 
435 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.18 
 
 
465 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  31.75 
 
 
446 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  34.7 
 
 
434 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 
452 aa  204  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.78 
 
 
448 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.2 
 
 
453 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  31.52 
 
 
446 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
448 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.1 
 
 
430 aa  203  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.65 
 
 
448 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  32.94 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.1 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.94 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.01 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  32.43 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.15 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  32.29 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.11 
 
 
481 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  31.02 
 
 
447 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  30.21 
 
 
446 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.18 
 
 
465 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.86 
 
 
448 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  29.69 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  32.86 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  32.94 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  31.09 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.48 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  31.74 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.11 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.62 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  31.74 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  31.98 
 
 
446 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.61 
 
 
448 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.6 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  29.91 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  32.04 
 
 
444 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.42 
 
 
460 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  28.29 
 
 
444 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  31.7 
 
 
486 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.7 
 
 
469 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  31.17 
 
 
447 aa  193  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  29.25 
 
 
450 aa  193  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  34.26 
 
 
460 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.32 
 
 
467 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.96 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  31.67 
 
 
446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.89 
 
 
463 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  29.38 
 
 
440 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  27.52 
 
 
449 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.97 
 
 
445 aa  189  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 
444 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>