More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0057 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 435 aa  868    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.92 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.46 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.63 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  36.75 
 
 		 449 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  36.53 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 		 457 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.83 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.65 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.15 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.32 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.27 
 
 		 438 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  31.31 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.91 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 		 442 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  27.9 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.38 
 
 		 446 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  29.69 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  27.29 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.64 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 453 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  27.68 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  28.18 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  28.32 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  31.82 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.82 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  32.27 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  28.57 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  28.47 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.23 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  27.71 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  28.7 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.26 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  30.28 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.41 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.4 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  29.93 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  31.25 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  31.12 
 
 		 455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  25.56 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  32.49 
 
 		 440 aa  133  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  26.85 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3908  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.67 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3845  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.25 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.67 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  31.82 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  29.54 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  30.62 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  30.62 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.03 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.77 
 
 		 441 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.8 
 
 		 448 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  30.07 
 
 		 460 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  29.84 
 
 		 447 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  30.8 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  30.43 
 
 		 448 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  32.09 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  29.59 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  28.31 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  28.95 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.6 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  28.7 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28 
 
 		 450 aa  128  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  28 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  28 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.44 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  28 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  28 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.97 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  29.79 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.62 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  30.95 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  30.95 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  28 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.73 
 
 		 437 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>