More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1482 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
442 aa  885    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.14 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.86 
 
 
462 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.02 
 
 
445 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.12 
 
 
445 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  35.92 
 
 
446 aa  292  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 
445 aa  289  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.32 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
447 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 
446 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
446 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.42 
 
 
446 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  33.26 
 
 
449 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.23 
 
 
437 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  33.03 
 
 
449 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  32.13 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 
444 aa  199  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 
438 aa  183  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  25 
 
 
452 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  27.33 
 
 
444 aa  169  9e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  28.73 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.79 
 
 
457 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  26.3 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.8 
 
 
435 aa  163  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.2 
 
 
441 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 
450 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 
470 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
435 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 
460 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  26.11 
 
 
432 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  24.45 
 
 
455 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 
436 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
448 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  27.36 
 
 
444 aa  149  7e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
448 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  24.66 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.45 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  27.19 
 
 
467 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  25.91 
 
 
446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 
448 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 
448 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  26.21 
 
 
446 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  24.04 
 
 
452 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  26.23 
 
 
450 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.61 
 
 
435 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.82 
 
 
455 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  25.53 
 
 
450 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  26.15 
 
 
446 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  25.69 
 
 
450 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.16 
 
 
456 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 
445 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  26.19 
 
 
434 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  26.15 
 
 
450 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.69 
 
 
450 aa  143  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  26.15 
 
 
446 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  26.15 
 
 
446 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  26.15 
 
 
446 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  26.15 
 
 
446 aa  143  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  26.15 
 
 
450 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.21 
 
 
448 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.26 
 
 
420 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.57 
 
 
420 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  25.46 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  25.46 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  25.46 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  25.46 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  25.97 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  24.57 
 
 
455 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.57 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  26.47 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.37 
 
 
420 aa  140  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25.24 
 
 
447 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 
453 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  26.47 
 
 
452 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.43 
 
 
460 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 
452 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.48 
 
 
481 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.44 
 
 
448 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  23.88 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 
452 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.9 
 
 
446 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.66 
 
 
441 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  25.18 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  25.18 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  27.62 
 
 
461 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  23.78 
 
 
446 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  27.39 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.44 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  24.04 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  27.38 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  27.38 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  25.18 
 
 
446 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  31.58 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>