More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1709 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 445 aa  897    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.94 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  65.92 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.63 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.28 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.84 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.58 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.68 
 
 		 447 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.61 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.12 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.01 
 
 		 446 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.48 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.16 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  29.56 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  29.33 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  29.28 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  30.88 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  29.58 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  32.08 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 435 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  29.2 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.74 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 453 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.42 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 		 441 aa  172  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.29 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  29.27 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.5 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  30.66 
 
 		 464 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.57 
 
 		 460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.67 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  28.34 
 
 		 450 aa  163  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.26 
 
 		 447 aa  163  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.23 
 
 		 430 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  29.63 
 
 		 473 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  28.82 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  27.88 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  27.88 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  30.8 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  27.78 
 
 		 446 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  29.17 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  27.94 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  28.7 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.38 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  27.94 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  28.18 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  27.94 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  27.94 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  29.89 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  28.4 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  27.71 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  27.71 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  28.41 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  28.51 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  31.03 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.07 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.36 
 
 		 465 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.57 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  27.4 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  27.71 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  27.71 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  28.64 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  27.71 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  27.71 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.93 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  28.41 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.42 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  26.11 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  28.74 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.53 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.14 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.95 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  28.47 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  30.02 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  28.24 
 
 		 452 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.76 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  29.28 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.33 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.21 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>