More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0882 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
436 aa  873    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  60.78 
 
 
436 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.81 
 
 
450 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.98 
 
 
427 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.36 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.78 
 
 
430 aa  224  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 
445 aa  221  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.38 
 
 
425 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.01 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 
457 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  32.07 
 
 
430 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 
462 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 
450 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.52 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.61 
 
 
445 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  29.84 
 
 
446 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.95 
 
 
435 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 
420 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 
420 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 
420 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
446 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
446 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.83 
 
 
442 aa  170  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 
433 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  28.7 
 
 
449 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 
442 aa  152  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 
435 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.19 
 
 
437 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 
433 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  27.64 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 
442 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  26.19 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  25.88 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 
443 aa  137  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.28 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
460 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 
427 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.45 
 
 
441 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.72 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.4 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
460 aa  120  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.02 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.85 
 
 
475 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  26.6 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.58 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  26.17 
 
 
448 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
447 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  26.68 
 
 
444 aa  113  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  23.74 
 
 
481 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 
481 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.8 
 
 
476 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 
483 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  32.49 
 
 
460 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.77 
 
 
464 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.64 
 
 
465 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.53 
 
 
444 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.3 
 
 
477 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
438 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  24.03 
 
 
479 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.64 
 
 
462 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.46 
 
 
462 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3957  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.05 
 
 
440 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.259063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  23.74 
 
 
483 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 
479 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.58 
 
 
458 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.95 
 
 
495 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.99 
 
 
464 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 
480 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 
465 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.25 
 
 
488 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  24.59 
 
 
437 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  24.43 
 
 
452 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  24.18 
 
 
461 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  24.36 
 
 
481 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.66 
 
 
470 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  24.21 
 
 
452 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.17 
 
 
475 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 
475 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  24.23 
 
 
471 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  25.49 
 
 
470 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  24.18 
 
 
474 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.29 
 
 
474 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 
479 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  25.27 
 
 
470 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.54 
 
 
479 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  24.35 
 
 
475 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  23.61 
 
 
481 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 
458 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.02 
 
 
489 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  25.69 
 
 
464 aa  99.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>