More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1165 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 444 aa  898    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.52 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.72 
 
 		 462 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 450 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.21 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.27 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 		 445 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 437 aa  183  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.77 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.85 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.97 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  30.46 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  29.03 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  29.93 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.58 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  29.23 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.22 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.03 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  29.06 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  25.43 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  28.13 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  24.56 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  25.17 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  24.94 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  24.94 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  24.94 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  27.85 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  24.94 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  25.17 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  24.72 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  24.72 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  24.72 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  24.83 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.62 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  24.83 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  24.83 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.94 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  24.72 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  24.59 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.77 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  26.33 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  26.45 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.3 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  25.99 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  24.06 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.62 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  25 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  26.05 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  23.9 
 
 		 450 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  25.73 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  24.09 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  25.52 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.96 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  22.61 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.81 
 
 		 473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  23.75 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  23.66 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.16 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.19 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.84 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  25.9 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  24.31 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  22.91 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.49 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  22.91 
 
 		 446 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.84 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.84 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.71 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.3 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  27.16 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  25.18 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  26.62 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  27.27 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.79 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.88 
 
 		 465 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  26.07 
 
 		 453 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  24.88 
 
 		 447 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  23.73 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  24.88 
 
 		 447 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  25.38 
 
 		 446 aa  116  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  25.29 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>