More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0776 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 437 aa  887    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 		 457 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.74 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.37 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.16 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.52 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  28.73 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.23 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.28 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.14 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.33 
 
 		 446 aa  216  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.34 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.84 
 
 		 435 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.91 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.6 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  29.93 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  29.81 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  26.59 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  28.41 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  28.1 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.81 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  28.71 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.62 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  26.15 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.27 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.92 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 		 447 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.71 
 
 		 448 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 460 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.19 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 		 448 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  26.42 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.26 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.19 
 
 		 452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.21 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  24.94 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  27.27 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.94 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.39 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 468 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  25.97 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.04 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  25.92 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.05 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  25.68 
 
 		 440 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  27.82 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  25.68 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.2 
 
 		 427 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  27.79 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  26.14 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.89 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.8 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  25.23 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.66 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  28.06 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.54 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.86 
 
 		 489 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  25.82 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  24.09 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.81 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  24.88 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  26.67 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  24.48 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.76 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  23.72 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  27.01 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.76 
 
 		 450 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  26.76 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  26.76 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  26.76 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  26.76 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  25.78 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  26.52 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  26.52 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  26.1 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.6 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  25.56 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  25.85 
 
 		 446 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.24 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  26.52 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>