More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0591 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 452 aa  915    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.39 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  27.89 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.76 
 
 		 450 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.87 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.71 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.84 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.28 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  22.97 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.6 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.24 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  24.94 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.47 
 
 		 437 aa  100  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  23.71 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  26.42 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.5 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.5 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.85 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 445 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.82 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.51 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  25.85 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.83 
 
 		 475 aa  94  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.6 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.85 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  28.38 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  28.38 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.29 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.53 
 
 		 420 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 		 457 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.76 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.97 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.21 
 
 		 450 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  23.98 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  23.34 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  22.15 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0887  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.15 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  23.34 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.36 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.78 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.12 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  23.01 
 
 		 446 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.6 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.83 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.55 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6114  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.73 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  23.29 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  24.03 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  22.45 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  23.36 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.79 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  22.27 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  22.27 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.45 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.51 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  28.57 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  23.58 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.58 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  23.58 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  23.72 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.72 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  27.27 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  27.12 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  22.37 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  23.8 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  22.99 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.59 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  23.13 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  23.13 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  23.13 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  21.22 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  19.95 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  19.68 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  23.13 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  22.09 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>