More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2096 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 445 aa  914    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.7 
 
 		 445 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.4 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.49 
 
 		 449 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.93 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.2 
 
 		 444 aa  501  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.21 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.59 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  30 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 		 465 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  30.24 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  30.91 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  29.74 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  29.31 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  30.33 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  29.44 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  35.53 
 
 		 511 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  28.6 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  30.56 
 
 		 472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.23 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  35.15 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  28.48 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  28.03 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  37.24 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  28.48 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  28.48 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  26.08 
 
 		 459 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 		 492 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 433 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.05 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 452 aa  96.7  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25.78 
 
 		 453 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 		 445 aa  89.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  27.78 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.97 
 
 		 439 aa  87  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23.71 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.27 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.63 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.81 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  24.63 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.84 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.84 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  23.71 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  25.99 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.56 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.56 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.3 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.56 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.56 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  26.18 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  26.71 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  27.56 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.83 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  23.04 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.85 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  24.39 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.53 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  24.39 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.96 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  24.58 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.38 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.95 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  23.47 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  24.09 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.27 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.9 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.14 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  22.49 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.69 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  21.7 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  24 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.43 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  24.3 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  24.1 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.78 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  24.28 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.21 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.32 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  24.2 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.59 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.49 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  21.7 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.5 
 
 		 457 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  26.32 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.96 
 
 		 468 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  25.27 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  23.59 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  22.45 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.15 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  22.52 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.44 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  21.5 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  22.38 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.79 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  23.04 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.46 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  21.67 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>