More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1331 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 445 aa  914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.7 
 
 		 445 aa  774    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.85 
 
 		 439 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.15 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.24 
 
 		 444 aa  521  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.02 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  31.09 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  31.06 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  30.97 
 
 		 466 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  32.54 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  30.89 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  29.04 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  29.5 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  35.22 
 
 		 511 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  31.33 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  29.05 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  31.14 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  31.9 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.88 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  31.78 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  31.68 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  31.68 
 
 		 456 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  39.83 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  28.39 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.92 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  26.09 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  25.51 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.08 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.44 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.06 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  25.39 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.39 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.39 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.57 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.57 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  25.6 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.39 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.88 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  25.37 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.36 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.79 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  25.49 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  25.58 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.84 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.45 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.34 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  24.84 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.01 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.2 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  24.25 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  21.95 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  21.5 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.34 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  22.73 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  25.91 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.48 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.22 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.1 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.58 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  25.2 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.03 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.22 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  25.2 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  24.19 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.68 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  23.31 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.32 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  25.4 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.97 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  22.95 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.27 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  24.3 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.16 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  22.62 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.95 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  24.55 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.67 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  22.51 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.11 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  22.94 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.09 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.93 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6114  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.9 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.05 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  24.27 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.21 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  23.04 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>