70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12337 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  915    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  75.49 
 
 
456 aa  657    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  74.84 
 
 
456 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  74.84 
 
 
456 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  70.68 
 
 
457 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  69.37 
 
 
457 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  52.75 
 
 
463 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  53.19 
 
 
478 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  52.14 
 
 
465 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  54.61 
 
 
466 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  51.48 
 
 
472 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  52.01 
 
 
479 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.66 
 
 
471 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  49.36 
 
 
464 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  46.26 
 
 
509 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  47.76 
 
 
472 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  56.92 
 
 
511 aa  343  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  44.06 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.54 
 
 
445 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.69 
 
 
444 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 
443 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 
445 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 
449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.11 
 
 
444 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.36 
 
 
443 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.34 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
470 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.91 
 
 
467 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.99 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.08 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.69 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  39.53 
 
 
439 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  38.1 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25.42 
 
 
453 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  29.81 
 
 
444 aa  57  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  24.77 
 
 
448 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  34.74 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.89 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  26.61 
 
 
443 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  24.59 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  27 
 
 
441 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  32.56 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  37.5 
 
 
441 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.61 
 
 
452 aa  50.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  28.48 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  25.42 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.42 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.42 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.42 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.42 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.42 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  23.36 
 
 
453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  28.32 
 
 
453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.03 
 
 
356 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.77 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.72 
 
 
435 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.87 
 
 
427 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  30.12 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.87 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.69 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  21.99 
 
 
449 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  19.01 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  37.74 
 
 
439 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.01 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  21.58 
 
 
449 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.46 
 
 
445 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>