95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0750 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  100 
 
 		 439 aa  876    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  67.88 
 
 		 439 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  57.47 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  57.6 
 
 		 441 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  57.37 
 
 		 441 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  57.14 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  57.14 
 
 		 441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  55.71 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  55.48 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  54.79 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  54.57 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  46.94 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  46.94 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  45.8 
 
 		 453 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  47.17 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  47.17 
 
 		 453 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  47.17 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  47.17 
 
 		 453 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  46.94 
 
 		 453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  46.94 
 
 		 453 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  46.03 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  43.64 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  44.6 
 
 		 418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  38.44 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  39.69 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  32.81 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  36.65 
 
 		 447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  36.65 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  37.5 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.59 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.37 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.94 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.18 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.87 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  27.68 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.73 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.07 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.21 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  25.32 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  26.89 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  26.89 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  26.89 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.15 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  26.61 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  26.73 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  25.55 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.02 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  24.9 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  39.53 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  36.23 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  25.1 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  24.71 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  24.71 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.71 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  24.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  24.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  24.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.26 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  28.95 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  24.71 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  24.71 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.72 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  25.57 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  30.72 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  26.67 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  25.19 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  27.04 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  25.77 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  26.14 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.87 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.59 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  28.74 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  28.65 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  34.67 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  40.74 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.47 
 
 		 469 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  25.65 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  30.26 
 
 		 485 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.34 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.93 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  28.82 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>