70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4122 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  100 
 
 
447 aa  915    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  99.33 
 
 
447 aa  908    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  65.1 
 
 
447 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  57.24 
 
 
448 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  41.06 
 
 
444 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  42.79 
 
 
454 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  40.55 
 
 
443 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  39.04 
 
 
453 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  39.59 
 
 
445 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  36.58 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  38.91 
 
 
441 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  39.06 
 
 
439 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  35.55 
 
 
444 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  39.29 
 
 
439 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  39.06 
 
 
439 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  37.23 
 
 
418 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  36.34 
 
 
453 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  36.34 
 
 
453 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  37.76 
 
 
453 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  36.1 
 
 
454 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  36.1 
 
 
453 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  36.1 
 
 
454 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  36.1 
 
 
453 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  38.72 
 
 
441 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  36.58 
 
 
453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  37.9 
 
 
441 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  37.44 
 
 
441 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  36.65 
 
 
439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  37.56 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.4 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.54 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.27 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  26.14 
 
 
478 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.07 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.25 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.41 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.39 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.8 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.17 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.85 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  23.63 
 
 
620 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.92 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  26.59 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  26.74 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 
463 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.87 
 
 
448 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.53 
 
 
448 aa  46.6  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  26.94 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.71 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  25.71 
 
 
450 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  25.71 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  25.71 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  25.71 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  25.71 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  25.71 
 
 
450 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  25.24 
 
 
450 aa  44.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.35 
 
 
457 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  29.48 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  24.76 
 
 
450 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  26.12 
 
 
432 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  25.84 
 
 
457 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
447 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  29.79 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.37 
 
 
448 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>