82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4000 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  100 
 
 
447 aa  916    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  65.1 
 
 
447 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  64.88 
 
 
447 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  57.37 
 
 
448 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  39.68 
 
 
444 aa  352  1e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  44.15 
 
 
454 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  43.06 
 
 
439 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  42.82 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  41 
 
 
443 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  41.41 
 
 
439 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  40.14 
 
 
445 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  40.77 
 
 
441 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  40.64 
 
 
441 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  37.53 
 
 
444 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  39.95 
 
 
441 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  39.91 
 
 
441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  36.85 
 
 
453 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  36.93 
 
 
453 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  37.89 
 
 
453 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  37.71 
 
 
418 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  39.18 
 
 
439 aa  269  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  36.7 
 
 
453 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  36.7 
 
 
453 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  37.5 
 
 
439 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  36.47 
 
 
453 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  36.47 
 
 
454 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  36.47 
 
 
453 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  36.47 
 
 
454 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  36.34 
 
 
453 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 
439 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.27 
 
 
445 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  27.56 
 
 
479 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  24.89 
 
 
620 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.62 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 
443 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.96 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  24.29 
 
 
478 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.57 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.9 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  27.78 
 
 
472 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  25.51 
 
 
459 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.52 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
438 aa  50.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  31.3 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  30.84 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.84 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  30.84 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  30.84 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  32.48 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  30.84 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  30.84 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0549  pmbA protein  19.27 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  30.84 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  30.84 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  29.91 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  31.3 
 
 
446 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  30.25 
 
 
443 aa  47  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
456 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.75 
 
 
444 aa  47  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  24 
 
 
447 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  26.09 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  28.97 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  26.05 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  28.97 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  28.97 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  28.97 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  28.97 
 
 
446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  26.05 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  26.05 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.59 
 
 
457 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  32.48 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  23.56 
 
 
511 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  27.88 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.88 
 
 
455 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 
468 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  27.61 
 
 
446 aa  43.1  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>