71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  863    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  67.88 
 
 		 439 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  62.36 
 
 		 441 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  60.54 
 
 		 441 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  59.09 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  58.62 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  58.05 
 
 		 441 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  58.28 
 
 		 441 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  58.94 
 
 		 439 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  57.08 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  56.85 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  47.94 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  45.12 
 
 		 453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  48.39 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  48.39 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  48.39 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  48.39 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  48.39 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  48.39 
 
 		 453 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  44.72 
 
 		 453 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  44.72 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  45.48 
 
 		 418 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  42.95 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  42.03 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  38.07 
 
 		 448 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  39.18 
 
 		 447 aa  269  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  37.56 
 
 		 447 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  37.56 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  32.73 
 
 		 444 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.18 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.8 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.69 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.61 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.79 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.25 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.32 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.95 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.77 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.73 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  28.17 
 
 		 479 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  34.94 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  36.14 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  35.44 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.27 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  35.44 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  33.7 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  26.81 
 
 		 620 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  36.23 
 
 		 511 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.63 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  38.1 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.33 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  37.1 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  36 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  37.33 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  35.71 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  27.09 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  28.38 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.83 
 
 		 445 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.82 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.49 
 
 		 447 aa  46.6  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  34.78 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  33.7 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  34.81 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  30.97 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>