219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0313 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  70.79 
 
 
428 aa  645    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
428 aa  872    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.49 
 
 
426 aa  608  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.47 
 
 
427 aa  593  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.71 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.66 
 
 
445 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.96 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.5 
 
 
405 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.43 
 
 
435 aa  87  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  29.47 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.51 
 
 
454 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.37 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.19 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  23.86 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  27.84 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.36 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.39 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.04 
 
 
492 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  33.93 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.95 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  32.48 
 
 
453 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 
455 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.07 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.98 
 
 
446 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  23.3 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  25.78 
 
 
452 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  26.25 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  22.85 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.02 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.36 
 
 
438 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.11 
 
 
467 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1293  TldD/PmbA family protein  24.66 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00519979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  28.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.42 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  28.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  28.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  28.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  28.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  26.07 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  28.09 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.13 
 
 
452 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  27.48 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.74 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  28.77 
 
 
498 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.04 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.74 
 
 
474 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.43 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  31.25 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.87 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  21.96 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.9 
 
 
464 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 
462 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  27.66 
 
 
456 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.72 
 
 
442 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.86 
 
 
460 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 
462 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.49 
 
 
443 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  25.54 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.31 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  33.59 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.68 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.32 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.59 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.59 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  24.26 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  24.26 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.59 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.83 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.11 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.3 
 
 
470 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.68 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  25.66 
 
 
445 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.9 
 
 
458 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.53 
 
 
543 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.82 
 
 
444 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  33.83 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  25 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  25.47 
 
 
441 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>