201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1808 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
428 aa  860    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  70.79 
 
 
428 aa  645    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.15 
 
 
427 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.86 
 
 
426 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.97 
 
 
448 aa  267  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.84 
 
 
445 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 
433 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.43 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.22 
 
 
409 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.18 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.62 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.68 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.19 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  32.67 
 
 
473 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.38 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  28.06 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  33.93 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  23.3 
 
 
458 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.37 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.56 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  29.38 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  24.47 
 
 
462 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  34.48 
 
 
446 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  32.28 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  24.47 
 
 
462 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.95 
 
 
444 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.98 
 
 
461 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.07 
 
 
497 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 
456 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.89 
 
 
450 aa  60.1  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.02 
 
 
474 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  30.95 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
446 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.49 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.65 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.24 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  32.17 
 
 
461 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  24.71 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.35 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  27.27 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  33.6 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  32.94 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  33.6 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.79 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.57 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.82 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.99 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 
458 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.97 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  27.94 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.43 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  28.12 
 
 
446 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 
442 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  29.79 
 
 
460 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.59 
 
 
442 aa  53.9  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
458 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28 
 
 
485 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
444 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2570  microcin-processing peptidase 1  34.31 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  26.88 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.56 
 
 
458 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 
435 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0945  putative PMBA protein (tlde protein)  34.31 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0171463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  33.33 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  24.22 
 
 
453 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  27.24 
 
 
464 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23 
 
 
449 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.95 
 
 
492 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 
443 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.63 
 
 
458 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.54 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  28.73 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  32.35 
 
 
498 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  22.08 
 
 
449 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.15 
 
 
446 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.29 
 
 
488 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 
470 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.35 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.58 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.16 
 
 
456 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>