More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6028 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 467 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.51 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.94 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.27 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.97 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.17 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.78 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.84 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.17 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 		 443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  28.8 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  27.69 
 
 		 509 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  29.14 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  28.87 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  29.43 
 
 		 464 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  27.12 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.85 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.39 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  26.71 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  28.66 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  27.34 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.22 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.03 
 
 		 479 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  28.6 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  27.27 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  29.15 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  26.39 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  30.2 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.42 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  28 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  26.88 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  25.32 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  27.41 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  25.32 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  30.2 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  26.19 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.25 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.38 
 
 		 448 aa  76.6  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  30.12 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  24.68 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  25.9 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.08 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.61 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  29.67 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  28.09 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  29.85 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  27.74 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  26.6 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  30.92 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  26.6 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.31 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.6 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.9 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.46 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  30.95 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.74 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  25.27 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.46 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.15 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  25.85 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  26.35 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  28.5 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  26.35 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  26.35 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  29.13 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  26.35 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  26.73 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  23.71 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.23 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  27.5 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.1 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  24.32 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.82 
 
 		 428 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  29.45 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.63 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.22 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.37 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>