166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3766 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  79.71 
 
 
492 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
470 aa  918    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.16 
 
 
467 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.41 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.89 
 
 
465 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.41 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
445 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
444 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.05 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.11 
 
 
444 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 
439 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
443 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.88 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
471 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  31.45 
 
 
472 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  35.29 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  34.45 
 
 
464 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  29.81 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  33.98 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  30.26 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  29.43 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  31.8 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  31.34 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  31.34 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.4 
 
 
427 aa  80.1  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  30.36 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.44 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  27.95 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.55 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  31.73 
 
 
466 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  32.08 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  27.39 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  29.69 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.5 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  33.73 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  28.09 
 
 
453 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  28.09 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  28.09 
 
 
454 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  28.09 
 
 
453 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  28.09 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  28.09 
 
 
454 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  28.16 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  28.5 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  28.6 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  41 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  31.84 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  27.34 
 
 
430 aa  69.7  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  28.7 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  52.73 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 
448 aa  66.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  27.36 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.4 
 
 
428 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.06 
 
 
439 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
446 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  30.41 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  27.74 
 
 
439 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  31.03 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  28.44 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
465 aa  60.1  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  28.44 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.09 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  24.61 
 
 
620 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.43 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  27.96 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 
438 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  25.82 
 
 
443 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.62 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  25.26 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  26.85 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  22.42 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
459 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  24.56 
 
 
448 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.69 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  25.58 
 
 
447 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 
445 aa  53.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  25.58 
 
 
447 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  27.36 
 
 
460 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.9 
 
 
491 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.19 
 
 
436 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.71 
 
 
425 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  26.39 
 
 
439 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.6 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  27.31 
 
 
439 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  25.66 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 
463 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  30.15 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 
479 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.52 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  28.83 
 
 
464 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  25.7 
 
 
486 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 
486 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.18 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  21.67 
 
 
449 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>