More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10471 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  95.89 
 
 
462 aa  901    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  100 
 
 
462 aa  934    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  56.32 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  53.71 
 
 
456 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  55.28 
 
 
455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  56.94 
 
 
450 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10271  putative modulator of DNA gyrase  56.94 
 
 
450 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.229888  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09181  putative modulator of DNA gyrase  56.5 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  55.06 
 
 
450 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  54.47 
 
 
459 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  47.78 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  49.89 
 
 
453 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.3 
 
 
446 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.42 
 
 
446 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.42 
 
 
446 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.09 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  26.76 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.01 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  26.76 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.54 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 
452 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.71 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  27.03 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.28 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  23.3 
 
 
446 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.42 
 
 
441 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.12 
 
 
450 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.26 
 
 
442 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.47 
 
 
445 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.14 
 
 
457 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.78 
 
 
447 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.48 
 
 
445 aa  100  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.63 
 
 
446 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25 
 
 
473 aa  93.6  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  24.11 
 
 
450 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  24.59 
 
 
446 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  24.11 
 
 
450 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  24.59 
 
 
446 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  24.59 
 
 
446 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  23.87 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  23.87 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  23.87 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  23.87 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  24.59 
 
 
446 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358914 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.87 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  24.59 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  22.93 
 
 
464 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  24.35 
 
 
450 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 
438 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  24.35 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  23.88 
 
 
450 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.99 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  22.97 
 
 
447 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 
465 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.76 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.94 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.44 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0781  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.41 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0539475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  22.17 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.48 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  21.86 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 
479 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.33 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  22.33 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.87 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2965  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.17 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194502  normal  0.400947 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.98 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.09 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.42 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.61 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  22.12 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  26.51 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  20.98 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  21.63 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  28.23 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  22.09 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  23.76 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.58 
 
 
468 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.16 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.61 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  22.54 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.2 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.76 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  23.13 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  23.91 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.09 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.64 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.57 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.7 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  23.91 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.2 
 
 
436 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.85 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.97 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  21.97 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.97 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.05 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>