More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1167 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  71.78 
 
 		 461 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 455 aa  924    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  81.76 
 
 		 456 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10271  putative modulator of DNA gyrase  56.22 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.229888  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  55.56 
 
 		 450 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  55.56 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  55.36 
 
 		 459 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  55.21 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  55.28 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09181  putative modulator of DNA gyrase  53.01 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  52.94 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  52.37 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.45 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.68 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.33 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.33 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.92 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  26.1 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.56 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  25.48 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  26.86 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.41 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.55 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  26.64 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.33 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.18 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  25.05 
 
 		 446 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.4 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.5 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  24.24 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.62 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  24.48 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.6 
 
 		 447 aa  90.1  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.89 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.77 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.98 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.13 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.84 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.03 
 
 		 447 aa  86.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  23.98 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.67 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.38 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  31.2 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  25.71 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  24.18 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  26.5 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  27.92 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.55 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.3 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.7 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  24.17 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.18 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.99 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.8 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  27.35 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.98 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.94 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  24.21 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.22 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.97 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  28.17 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  25.61 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.83 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  25.24 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  25.24 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  23.96 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  23.96 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.65 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  23.96 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  23.96 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  25.81 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.96 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  25.81 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  24.49 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.9 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  25.56 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>