More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1901 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 426 aa  867    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.49 
 
 		 428 aa  608  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.96 
 
 		 427 aa  599  1e-170  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.86 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.85 
 
 		 448 aa  259  6e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.95 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.42 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.73 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.49 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  35.88 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  37.68 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  33.33 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  28.92 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  32.73 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.68 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.31 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.04 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  31.18 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09181  putative modulator of DNA gyrase  31.33 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.76 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.75 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10471  putative modulator of DNA gyrase  28.47 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0348305  hitchhiker  0.00321513 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0365  putative modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.52 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.53 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.61 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.24 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14411  putative modulator of DNA gyrase  30.91 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  34.92 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  29.15 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  19.29 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.8 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 446 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.1 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.47 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  29.17 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10271  putative modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.229888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.94 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25.77 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  27.33 
 
 		 445 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.11 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  29.8 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.64 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0389  pmbA protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2954  pmbA protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4195  microcin-processing peptidase 1  37.5 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  31.95 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2532  pmbA protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.54 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0905  pmbA protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2904  TldD/PmbA family protein  29.89 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.23 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.93 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2844  TldD/PmbA family protein  29.52 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.78 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.13 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  32.12 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  26.75 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.17 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.27 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.83 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.3 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  31.45 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  30.41 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.24 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.96 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.82 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  36 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  23.97 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.69 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>