More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1232 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
433 aa  883    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 
445 aa  222  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.48 
 
 
448 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.05 
 
 
427 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.9 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 
426 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 
428 aa  164  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.23 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 
428 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.03 
 
 
445 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 
444 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.72 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 
445 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 
439 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.24 
 
 
439 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 
435 aa  97.8  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 
444 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  31.7 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.68 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  31.22 
 
 
445 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.63 
 
 
430 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.5 
 
 
473 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  34.95 
 
 
449 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.56 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.04 
 
 
470 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  30.69 
 
 
460 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  34.47 
 
 
449 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.19 
 
 
460 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 
445 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 
479 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.88 
 
 
449 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.3 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.97 
 
 
436 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  29 
 
 
460 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 
446 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.04 
 
 
441 aa  87.4  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.35 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.51 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.58 
 
 
473 aa  86.7  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.35 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.2 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.29 
 
 
462 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  28.88 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  29.7 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6114  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.68 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.95 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.43 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.73 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.85 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  26.67 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.48 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  23.49 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.72 
 
 
465 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.76 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  24.16 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.97 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.46 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 
435 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  28.57 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  29.46 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.82 
 
 
445 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  27.17 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.56 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.02 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.57 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.32 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  30.16 
 
 
445 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  25.45 
 
 
447 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  28.66 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.46 
 
 
425 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.02 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  26.6 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.44 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
428 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  28.24 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  28.24 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  26.7 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.33 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.07 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  20.96 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  31.17 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  26.77 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.63 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>